La plataforma MANU-KET se estructura a través de su Asamblea General y su Consejo Gestor. Tanto INVEMA como la Corporación MONDRAGON conforman la Secretaría Técnica encargada de la gestión de la plataforma.
Asamblea General
Es el principal órgano de gobierno y está constituido por todas las entidades asociadas a la plataforma MANU-KET. Tiene un carácter abierto y transparente, sirviendo como foro de encuentro y colaboración entre los integrantes de la actuación. Permite la supervisión de la gestión realizada por parte del Consejo Gestor y las actividades desarrolladas por los Equipos de Innovación.
Consejo Gestor
Está constituido por las entidades que desarrollan las actividades de Secretaría así como por aquellas empresas, universidades y centros de investigación nacionales referentes en fabricación. Sustenta la responsabilidad de desarrollar el Plan de Actuación anual y verificar su cumplimiento.
Secretaría Técnica
La Secretaría Técnica da soporte administrativo a la plataforma y se encarga de resolver los asuntos logísticos.
Grupos Interplataforma
Equipos de trabajo integrados de manera voluntaria por miembros de diferentes plataformas tecnológicas españolas con intereses comunes en temáticas particulares, con el objetivo de identificar soluciones innovadoras.